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【学位论文】 作者： 邓磊 导师：朱斐 苏州大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术（硕士） 2023年
【摘要】 蛋白质翻译后修饰(Post-translationalmodification,PTM)在各种细胞信号通路和生物学过程中发挥着至关重要的作用，PTM不仅可以通过修饰单个残基来调节各种信号通路，还可以通过蛋白质内部或蛋白质间不同修饰残基的相互...
【学位论文】 作者： 邵爱斌 导师：杨洋 苏州大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术（硕士） 2022年
【摘要】 氨基酸变异的耐受性，指的是蛋白质对其位点上发生的氨基酸变异的容忍程度。耐受性高的变异通常对蛋白质功能没有影响，也被简称为中性。相反，耐受性低的变异大概率有害，其中发生在人类蛋白质上的低耐受性变异常被称为致病变异。用计算方法预测变异耐受性比实...
【学位论文】 作者： 孙晓雨 导师：吕强 苏州大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术（硕士） 2021年
【摘要】 基因表达的生物系统受到DNA和转录因子(Transcription Factor，TF)相互作用的调控。在TF结合域发生的核苷酸变异在人类疾病中扮演着重要角色。染色质免疫沉淀测序技术(ChIP-seq)可以高通量检测DNA-TF结合性的生化...
【学位论文】 作者： 仇瑛姿 导师：吕强 苏州大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术（硕士） 2019年
【摘要】 生物序列是指DNA序列或蛋白质氨基酸序列。多序列比对是指三条以上类似长度的生物序列的比对。所谓序列比对是指具有两序列最优相似性的对准排列。由于高通量测序等生化技术的发展，生物序列海量普遍增长。多序列比对越来越被普遍应用于生物学的有关领域中。...
【学位论文】 作者： 顾倜 导师：吕强 苏州大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术（硕士） 2017年
【摘要】
RNA在表达蛋白质的遗传信息中起重要作用。为了了解RNA如何执行它们的功能，我们需要知道它们的结构。假结是RNA中一种重要的二级结构，由于建模的困难导致它更难被预测。本文用多目标优化方法研究带假结的RNA二级结构预测。
通过碱基之...
【学位论文】 作者： 曹成远 导师：吕强 苏州大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术（硕士） 2016年
【摘要】 残基对的相互作用描述了蛋白质三维结构中一对残基的空间距离关系，相互作用的残基对对维护蛋白质结构的稳定起着重要作用。蛋白质中所有残基对的相互作用关系确定了蛋白质三维结构的二维拓扑，所以得到准确的残基对相互作用关系对蛋白质三维结构预测有重要意义...
【学位论文】 作者： 沈可 导师：沈百荣 苏州大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术（硕士） 2016年
【摘要】 蛋白质是人类生命活动息息相关的生物大分子，本文从计算科学的角度研究分析蛋白质。本文主要分为两个部分:第一部分通过分析提取蛋白质的特征然后应用SVM的方法从蛋白质的一级结构出发预测蛋白质的可溶性;第二部分从统计模式分析并应用计算机软件方法，探...
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