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【学位论文】 作者： 叶晓伟 导师：张小鹏 刘锋  南京大学  物理学 物理学（硕士） 2019年

【摘要】 细胞是生物体的结构和功能单元。细胞通过基因表达调控和信号转导来应答胞内外的应激信号。构建信号转导网络的数学模型和开展数值计算，结合描述网络的动力学阐明网络中关键蛋白质响应行为的生物物理机制，被证明是揭示细胞应激响应机制的重要研究途径。缺氧诱...

【关键词】 细胞生物物理学； 缺氧应激；

【学位论文】 作者： 王平 导师：张小鹏 刘锋  南京大学  物理学 物理学（博士） 2019年

【摘要】 结合基因表达调控和信号转导来研究细胞的应激反应是细胞生物学的前沿课题。限于当前的实验技术条件，从单细胞水平阐明这些反应的分子机制依然是一个巨大挑战。即使能做到单细胞水平的测量，往往也只能给出在某些时间点上的测量数据，而反应本身却是动态变化的...

【关键词】 p53蛋白； HIF-1α蛋白；

【学位论文】 作者： 管笛 导师：刘锋  南京大学  生物学 生物物理（硕士） 2019年

【摘要】 生物钟是指周期接近24小时的内禀振荡，广泛存在于自然界的生物中;从简单的单细胞生物到复杂的哺乳动物，它们的生理代谢过程都被生物钟调控。生物钟的存在有利于生命体更好地适应外部环境并维持内环境稳定。许多疾病，例如抑郁、睡眠失调、代谢综合征甚至癌...

【关键词】 生物钟； 粗糙脉孢菌；

【学位论文】 作者： 倪腾飞 导师：刘锋  南京大学  物理学 物理学（硕士） 2018年

【摘要】 真核生物的遗传信息储存在细胞核内的DNA上，而执行生理功能的蛋白质大都在细胞质中发挥作用，mRNA是DNA和蛋白质之间的信息使者。是一部什么样的分子机器读取DNA信息并转录为mRNA?这个机器的工作原理如何？它的调控方式是怎样的？它如何保证...

【关键词】 细胞信号转导； 信使核糖核酸；

【学位论文】 作者： 李佳云 导师：刘锋  南京大学  物理学 物理学（硕士） 2018年

【摘要】 基因表达是细胞的基本生理活动，是一个复杂的动态过程，涉及大量的蛋白-DNA和蛋白-蛋白相互作用。刻画基因表达的动力学和分子调控机制是当前多学科交叉研究的前沿课题。
　　转录机器的功能是响应细胞信号，确保基因的选择性表达和恰当的起始速率...

【关键词】 基因表达； 转录动力学；

【学位论文】 作者： 王道光 导师：刘锋  南京大学  物理学 物理学（博士） 2017年

【摘要】 结合基因表达调控和信号转导来研究细胞的应激响应是当前的研究热点。p53蛋白是细胞最重要的肿瘤抑制因子之一，介导细胞应答多种应激信号，如DNA损伤、癌基因活化等。限于当前的实验条件，在单细胞水平上揭示细胞应激响应的分子机制依然是一个巨大挑战。...

【关键词】 p53蛋白； 细胞信号转导网络；

【学位论文】 作者： 李宁曦 导师：刘锋  南京大学  物理学 物理学（硕士） 2017年

【摘要】 细胞的生命活动需要能量的支持。细胞增殖和细胞存活都需要充足而稳定的能量供应。在外界葡萄糖受限甚至耗尽的条件下，细胞会发生周期阻断甚至凋亡。研究细胞对能量短缺的响应，对于理解细胞增殖和代谢的关系，以及肿瘤细胞的代谢转变都具有重要意义。目前，对...

【关键词】 细胞增殖； 低糖环境；

【学位论文】 作者： 黄博 导师：刘锋  南京大学  物理学 物理学（博士） 2016年

【摘要】 细胞是高度复杂的系统，由各种各样的分子构成。这些分子表现出极其复杂多样的相互作用。从系统生物学的角度看，这样一个系统可以由生化网络来描述，即相互作用的细胞分子可以视为相互连接的网络组分。研究生化网络的行为可以帮助在系统层面上理解细胞活动。网...

【关键词】 细胞分子； 基因调控网络；

【学位论文】 作者： 周春红 导师：刘锋  南京大学  物理学 物理学（博士） 2015年

【摘要】 细胞信号转导的研究对了解细胞基本生命活动的分子机制和揭示生命的本质有重要的意义。细胞每时每刻都在监控胞内外环境的变化，并针对不同的应激信号作出恰当的反应。肿瘤抑制因子p53可调控细胞应答多种应激信号，如DNA损伤、癌基因活化、端粒受损、组织...

【关键词】 细胞应答； 肿瘤抑制因子；

【学位论文】 作者： 王耀来 导师：刘锋 王炜 李俊  南京大学  物理学 物理学（博士） 2014年

【摘要】 自上世纪五十年代末分子生物学的“中心法则”提出起，探究基因转录的物质基础成了生命科学的基础性课题。到本世纪初，对实施转录的分子机器的结构解析基本完成。然而，转录机器的动态运转机制依旧未知。转录机器的功能是响应转录激活子浓度变化所携带的细胞信...

【关键词】 基因转录； 分子机器；