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            【学位论文】 作者:张子涵 导师:史华林   中国科学院大学   物理学 理论物理(博士) 2021年

            【摘要】 随着生物理论以及实验技术的发展,对于细胞生理学的研究方式不再局限于定性研究,定量的研究也在逐渐增加。与定性的研究方式相比,定量的研究更加精准,往往也可以给出更多的信息。近年来由于高通量显微镜和微流体等单细胞实验技术以及图像分析技术的发展,研...

            【关键词】 细菌群体生长率

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            【学位论文】 作者:李雷雷 导师:史华林   中国科学院大学   物理学 理论物理(硕士) 2021年

            【摘要】 细菌生理学是研究细菌生长代谢的学科,是生物学重要的学科分支。虽然细菌生理的研究已经有七八十年之久,随着科学技术的发展,研究者们可以得到比以前更为精确的数据,各种背景的研究者涌入这个学科,使得细菌生理学开始从描述性学科到定量学科发展。细胞大小...

            【关键词】 细菌生理学细胞大小控制

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            【学位论文】 作者:张智超 导师:史华林   中国科学院大学   物理学 理论物理(博士) 2020年

            【摘要】 细菌在处于指数生长期时,生长速率、细胞大小、蛋白质占比等表征细胞生理的各个量之间存在些许关系。其中两种分别是表示细胞大小和生长速率这两者之间的唯象关系,以及表示蛋白质质量分数与生长速率之间的唯象关系。前者是关于细胞大小的生长规律,后者是关于...

            【关键词】 细胞大小生长速率

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            【学位论文】 作者:管绍华 导师:史华林   中国科学院大学   物理学 理论物理(博士) 2020年

            【摘要】 随着现代生物技术的迅速发展,对于细胞中生物过程的理解逐步的从定性研究转向定量研究。使用定量的模型去理解、分析生物过程是现在生物学研究的一个热点。近年来,通过对生物网络中的网络模块进行分析,可以去理解其中生化网络模块的动力学,并且发现了网络模...

            【关键词】 生物系统网络模块

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            【学位论文】 作者:常晓雪 导师:史华林   中国科学院大学   物理学 理论物理(博士) 2015年

            【摘要】 sRNA介导的调控是一种在转录后水平,通过与mRNA碱基互补配而调控目标mRNA的蛋白翻译的方式。因为其在原核生物中的广泛存在和重要作用而引起人们大量研究。随着实验数据的积累,人们发现sRNA介导的调控构成一个复杂的网络,同一个sRNA可能...

            【关键词】 非编码核糖核苷酸调控网络

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            【学位论文】 作者:李睿 导师:史华林   中国科学院大学   物理学 理论物理(博士) 2014年

            【摘要】 在原核生物中,转录和翻译是耦合在一起的,转录尚在进行,翻译已经开始。在转录延伸过程中,新合成的mRNA上进行翻译的第一个核糖体可以抑制转录的暂停。在一些衰减子的前导肽上,转录和翻译的耦合可以决定转录终止子的开或关。在本论文中,我们首先用实验...

            【关键词】 转录终止子双顺反子操纵子

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            【学位论文】 作者:刘克松 导师:郑伟谋   史华林   中国科学院大学   物理学 理论物理(博士) 2013年

            【摘要】 本文主要讨论了脱氧核糖核酸(DNA)序列模体和蛋白质(protein)结构模体的问题。第一部分是关于DNA序列模体。它通常是序列特异的蛋白结合位点,比如核酸酶,转录因子的结合位点;其它的也有参与核糖体结合,信使RNA处理和转录终止。通常可以...

            【关键词】 DNA序列模体嵌入式马尔可夫链

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            【学位论文】 作者:张庆 导师:史华林   中国科学院大学   物理学 理论物理(博士) 2013年

            【摘要】 细菌的许多宏观生理行为是由基因调控决定的。反过来,基因调控也受到细菌各种生理行为的影响。本论文对细菌的一些生理行为与基因调控之间的相互依赖关系进行了定量系统的研究。
               在大肠杆菌中,CRP是一种全局转录因子,由cAMP激活,并负...

            【关键词】 非特异性结合转录活性

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            【学位论文】 作者:徐留芳 导师:史华林   郑伟谋   中国科学院研究生院   中国科学院大学   物理学 理论物理(博士) 2012年

            【摘要】 sRNA介导的基因沉默机制是近年来基因调控领域的一个热门课题。传统的反义sRNA一般通过与mRNA配对结合并共同降解来实现目标基因的沉默。在共降解模型下,sRNA介导的基因沉默具有阈值-线性响应特性和阈值附近的噪声增大特性。最近实验发现,在...

            【关键词】 催化式sRNA阈值-线性响应

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            【学位论文】 作者:郝悦 导师:史华林   中国科学院研究生院   中国科学院大学   物理学 理论物理(博士) 2011年

            【摘要】 小RNA是一类不编码蛋白质的短序列RNA,它是广泛存在于真核和原核生物中的与许多生命活动密切相关的调控因子。在细菌中,绝大多数小RNA(small RNA,sRNA)以反义机制作用于目标mRNA,影响其翻译和稳定性,最终导致基因沉默。这类小...

            【关键词】 小RNA基因沉默

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