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【学位论文】 作者：王云杰 导师：张利绒 内蒙古大学 物理学 物理学（硕士） 2024年
【摘要】 基因组的三维结构对于基因表达调控和细胞功能极为关键，染色质环（loop）是三维结构中一种重要结构单元，而且不同类型的loop具有不同的功能。研究发现，启动子-增强子互作(Promoter-Enhancer Interactions, PEI...
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- 结论：
- 概要：
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【学位论文】 作者：高洁 导师：张利绒 内蒙古大学 物理学 物理学（硕士） 2023年
【摘要】 前体mRNA的异常剪接会导致癌症，研究证实可变剪接（AS）在人类肺腺癌（LUAD）的增殖和迁移中起着至关重要的作用。本文针对LUAD,构建了三种常见模式的可变剪接事件集，分析了 LUAD和正常样本中三类可变剪接事件的特征，筛选得到了一致性好...
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【学位论文】 作者：韩璐 导师：张利绒 内蒙古大学 物理学 物理学（硕士） 2023年
【摘要】 转录因子通过与顺式调控元件结合参与基因转录的精确调控。哺乳动物的转录因子(TF)多达数千种，每一个转录因子通常不单独发挥作用，而是以一种组合的方式协同作用于DNA顺式调控元件，解析转录因子的协同性有助于深入理解基因的转录调控机制。针对人类基...
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【学位论文】 作者：关华 导师：张利绒 内蒙古大学 物理学 物理学（硕士） 2022年
【摘要】
可变剪接是调节基因表达和产生蛋白质多样性的重要机制。本文分析研究了单核苷酸变异和组蛋白修饰对基因可变剪接的影响。
首先，研究了单核苷酸变异对可变剪接的影响。基于一位51岁女性23种组织的RNA-seq数据，利用MISO计算了可变剪...
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【学位论文】 作者：柴露 导师：张利绒 内蒙古大学 物理学 物理学（硕士） 2022年
【摘要】 CCCTC结合因子(CTCF)是脊椎动物中广泛表达的一种蛋白质，在全基因组的ChIP-seq数据中发现的CTCF结合位点有成千上万个。本文通过对ENCODE数据库中转录因子CTCF的ChIP-seq数据进行统计，基于67个细胞系的CTCF结...
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【学位论文】 作者：冯永贤 导师：张利绒 内蒙古大学 物理学 物理学（硕士） 2021年
【摘要】 基因的差异表达往往受到DNA甲基化的调控，研究DNA甲基化与基因差异表达的关联有助于解析基因的表达调控机制，特别是与疾病相关的基因差异表达。本文利用TCGA数据库中肺鳞癌RNA-Seq数据结合DESeq2包和方差分析方法，构建了肺鳞癌相关的...
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【学位论文】 作者：杨彦超 导师：张利绒 内蒙古大学 物理学 物理学（硕士） 2021年
【摘要】 在人类基因组中，基因的表达水平和表达模式表现出巨大的多样性。尽管已经发现基因表达可以由转录因子（Transcriptionfactor,TF）和其他调控因子共同控制，但解密其复杂性仍然是一项艰巨的任务。在真核生物中，多种转录因子可以协同结合...
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