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              【学位论文】 作者: 朱海涛 导师:张贵军  浙江工业大学  控制科学与工程 控制科学与工程(硕士) 2023年

              【摘要】 蛋白质是具有重要生物学功能的基本大分子,是所有生命系统的基石,了解其三维结构对于药物研发、精准医疗、致病机理研究至关重要。蛋白质分为单结构域蛋白质和多结构域蛋白质,结构域之间通过复杂的相互作用形成多结构域蛋白质。随着深度学习的应用与发展,单...

              【关键词】 多结构域蛋白质深度学习

              浏览:0 被引:0 下载:0

              【学位论文】 作者: 葛锋其 导师:张贵军  浙江工业大学  控制科学与工程 控制科学与工程(硕士) 2023年

              【摘要】 蛋白质是生命活动的重要组成部分,它特定的三维结构决定了其独一无二的功能。通过计算获取蛋白质的三维结构被证明在多个领域中有非常重要的指导意义。随着深度学习技术在生物信息领域的不断深入应用,单结构域蛋白质预测的问题已经得到了有效解决。然而多结构...

              【关键词】 多结构域蛋白质域间距离预测

              浏览:0 被引:0 下载:0

              【学位论文】 作者: 刘俊 导师:张贵军  浙江工业大学  控制科学与工程 控制科学与工程(博士) 2023年

              【摘要】 蛋白质是生命活动的主要承担者,几乎支撑着生命的所有功能。蛋白质的功能取决于其独特的三维结构,获取蛋白质的三维结构是了解其生物功能的关键,具有重要的生物学和医学意义。通过X射线衍射、核磁共振和冷冻电镜等实验方法测定蛋白质的三维结构耗时、费力、...

              【关键词】 蛋白质结构预测模型质量评估

              浏览:0 被引:0 下载:0

              【学位论文】 作者: 金思融 导师:张贵军  浙江工业大学  其他 电子信息(硕士) 2023年

              【摘要】 近年来,深度学习技术已经广泛应用于高精度的残基对距离预测。通过预测得到的距离信息构建能量函数指导蛋白质折叠,进而能够预测出高精度的蛋白质结构模型。然而,现有方法预测的距离信息仍然不够完整和充分,并且不同方法预测的距离信息也存在差异和偏向性,...

              【关键词】 蛋白质结构预测

              浏览:0 被引:0 下载:0

              【学位论文】 作者: 徐旭瑶 导师:张贵军  浙江工业大学  其他 电子信息(硕士) 2023年

              【摘要】 通过模板结构提供拓扑信息和残基间相互作用信息来辅助预测目标蛋白质三维结构,被认为是蛋白质结构预测最为常见和有效的方法之一。基于同源模板的结构建模方法通常能够获得高精度的结果,同源模板往往在提供蛋白质家族之间的结构保守性信息和残基间作用关系等...

              【关键词】 蛋白质结构预测

              浏览:0 被引:0 下载:0

              【学位论文】 作者: 彭春祥 导师:张贵军 周晓根  浙江工业大学  控制科学与工程 控制科学与工程(博士) 2023年

              【摘要】 蛋白质是一切生命系统的基石,几乎支撑着生命的所有功能,从触发免疫反应到大脑思考的每一个生理过程。蛋白质的工作方式和功能很大程度上取决于其独特的三维结构,也就是常说的“结构决定功能”。因此,揭示蛋白质的空间结构是了解其生物功能,实现蛋白质折叠...

              【关键词】 多域蛋白质结构域组装

              浏览:0 被引:0 下载:0

              【学位论文】 作者: 何广星 导师:张贵军  浙江工业大学  控制科学与工程 控制科学与工程(硕士) 2023年

              【摘要】 蛋白质是生命体中最重要的有机分子之一,广泛存在于生物体内的各种细胞和组织中,并参与到生命活动的各个方面,如催化反应,传递信息,运输物质等。蛋白质的功能取决于它们的结构,预测蛋白质三维结构有助于了解蛋白质在细胞中活动中的功能,并通过药物发现调...

              【关键词】 蛋白质结构打分模型

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              【学位论文】 作者: 张福金 导师:李章维 张贵军  浙江工业大学  控制科学与工程 控制科学与工程(硕士) 2023年

              【摘要】 蛋白质是生命物质的基础,它的功能主要由其三维空间结构来决定。蛋白质结构解析对生物学功能研究具有重要的理论意义和实际应用价值。近年来,随着深度学习的发展,AlphaFold2的出现使得端到端静态蛋白质结构预测的精度取得了重大突破。然而,蛋白质...

              【关键词】 蛋白质残基间距离

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              【学位论文】 作者: 汪乾梁 导师:张贵军  浙江工业大学  其他 电子信息(硕士) 2023年

              【摘要】 结构域是蛋白质在进化、折叠和功能上的最小独立单元。蛋白质结构域信息对于实验解析和计算方法获取蛋白质三维结构都具有重要意义。从实验解析蛋白质结构来说,结构域的缺失可以降低蛋白质的灵活性,从而提高蛋白质的溶解度,因此如果能够确定结构域的话,更容...

              【关键词】 蛋白质结构域边界预测算法

              浏览:0 被引:0 下载:0

              【学位论文】 作者: 黄兆鸿 导师:张贵军  浙江工业大学  其他 电子信息(硕士) 2023年

              【摘要】 蛋白质折叠机制研究是分子生物的一个重要挑战,对于揭示生物大分子的运动规律、理解蛋白质错误折叠病的致病机理和设计蛋白质工程材料等方面都有重要意义。研究蛋白质折叠机制需要探索蛋白质折叠中间状态及其顺序。然而,传统生物实验方法探索蛋白质折叠中间状...

              【关键词】 蛋白质折叠路径预测系统

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