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【学位论文】 作者： 邹金坪 导师：施绍萍  南昌大学  数学 应用数学（硕士） 2023年

【摘要】 在人类与疾病的长期斗争中，特别是近年来新型冠状病毒感染在全球范围内大流行，药物发挥着越来越重要的作用。新药物的研发存在投入成本高，耗费时间长的问题。传统药物发现过程的主要挑战是化学分子的搜索空间巨大且离散，高通量筛选以及虚拟筛选的方法需要耗...

【关键词】 药物分子生成； 深度学习；

【学位论文】 作者： 胡鹏伟 导师：施绍萍  南昌大学  数学 概率论与数理统计（硕士） 2023年

【摘要】 近几十年来，随着各种新的疾病出现，药物研发变得极为重要。然而，药物研发的过程是十分繁琐的，且成功率极低。当一种新的疾病出现时，往往需要投入大量的人力和物力，并且需要耗费大量的时间才可能会有相关治疗的药物出现，这对病人来说是极为不利的，特别是...

【关键词】 药物研发； 分子设计；

【学位论文】 作者： 何欢 导师：施绍萍  南昌大学  数学 应用数学（硕士） 2022年

【摘要】 基因表达是基因型产生表型的最基本的层次，对于生物体的发育至关重要。人类基因组计划的成功完成，基因表达数据激增，这类数据的分析和处理成为探索其应用的主要瓶颈。精准医疗中，恶性肿瘤的药物靶点和生物标志物的精准预测识别，对患者临床治疗和癌症治愈具...

【关键词】 癌症分类； 基因选择；

【学位论文】 作者： 郭昕昀 导师：施绍萍  南昌大学  数学 应用数学（硕士） 2022年

【摘要】 磷酸化作为最重要的蛋白质翻译后修饰(PTM)之一几乎参与生物生命活动的全程，蛋白激酶之间的磷酸化级联则是细胞内信号整合和传播的核心机制，由于实验方法无法直接鉴定激酶信息，使用计算方法预测磷酸化位点的特异激酶逐渐成为研究热点。本文针对数据库中...

【关键词】 蛋白质翻译后修饰； 磷酸化位点；

【学位论文】 作者： 张菊 导师：施绍萍  南昌大学  数学 应用数学（硕士） 2021年

【摘要】 蛋白质是基因表达的产物，是生命中的基本元素，具有维持生物体生命活动的重要作用，这使得蛋白质组学成为后基因组时代生命科学中重要的研究领域。准确预测蛋白质，对蛋白质进行精准分类，对研究其结构及功能具有重要的意义。随着后基因组时代的发展，蛋白质数...

【关键词】 蛋白质预测； 深度学习；

【学位论文】 作者： 林丹 导师：施绍萍  南昌大学  数学 应用数学（硕士） 2021年

【摘要】 近年来，多肽作为新的诊断药物在治疗人类疾病方面显示出巨大的潜力，其中抗炎肽（AIPs）为自身免疫性疾病和炎症性疾病提供了新的治疗方法。相比于小分子非特异性抗炎药物，抗炎肽具有副作用小和更有效等特点。随着多肽数据的大量涌现，如何准确地识别抗炎...

【关键词】 抗炎肽； 特征编码；

【学位论文】 作者： 余佳麟 导师：施绍萍  南昌大学  数学 应用数学（硕士） 2020年

【摘要】 在后基因组时代，蛋白质组学是一个非常重要的研究内容。蛋白质作为一种基础物质是直接参与了人类的生命活动，通常需要通过进行翻译后修饰(Post-translational modifications,PTMs)才能转化为具备功能的成熟蛋白，然而...

【关键词】 赖氨酸； 翻译后修饰；

【学位论文】 作者： 陈国东 导师：施绍萍  南昌大学  数学 应用数学（硕士） 2019年

【摘要】 赖氨酸乙酰化修饰是一种被广泛研究且可逆的蛋白质翻译后修饰，对细胞的转录调控、中心代谢、蛋白质的合成、细胞周期、细胞形态、信号传导等诸多生理过程具有重要的意义。乙酰化修饰位点的识别是了解乙酰化蛋白分子机制的基础。虽然已经有越来越多的研究者发展...

【关键词】 原核生物； 赖氨酸；

【学位论文】 作者： 曹曼 导师：施绍萍  南昌大学  数学 计算数学（硕士） 2019年

【摘要】 蛋白质翻译后修饰，也称为共价修饰，是调控蛋白质功能的重要机制，在信号通路和生物学过程中发挥着不可替代的作用，并可逆地决定了细胞的动力学和可塑性。然而，随着蛋白质翻译后修饰数据的高通量发展，传统的实验方法往往是费力、费时和昂贵的，快捷便利的计...

【关键词】 机器学习； 蛋白质；