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【学位论文】 作者:杨丽萍 导师:李国君 山东大学 数学 运筹学与控制论(硕士) 2024年
【摘要】 蛋白质和DNA/RNA复合物作为一种结构复杂的生物大分子,广泛地分布在自然界中,解析结构是研究其功能的基础,对研究许多重要的生物过程意义重大。目前,研究生物大分子结构的方法主要是核磁共振技术、X射线晶体技术以及冷冻电子显微技术(cryo-E...
- 概要:
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【学位论文】 作者:李正奕 导师:李国君 山东大学 数学 运筹学与控制论(硕士) 2024年
【摘要】 生物信息学领域的迅猛发展,在过去几十年里推动了DNA测序技术的革命性变革。从Sanger测序的初创时期到Illumina等第二代测序技术的高通量时代,我们目睹了基因组学领域取得的巨大进步。然而,随着现代科学探究对于长读长、实时测序以及更为全...
【关键词】 纳米孔测序 ; barcodes标记 ;
- 概要:
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【学位论文】 作者:李頔 导师:李国君 山东大学 数学 运筹学与控制论(博士) 2024年
【摘要】 高通量测序技术的诞生为生物研究和医学领域带来了革新,其产生的大规模复杂的数据,为研究人员提供了更全面、更深入地理解生命过程和各种疾病的途径。随后,细胞分离技术的发展推动了单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术的出现,使得生物研究得到进一...
- 概要:
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【学位论文】 作者:孟亚茹 导师:李国君 山东大学 统计学 统计学(硕士) 2023年
【摘要】 细胞是生物体结构和功能的基本单位,其可以执行并完成生物体的各种特定功能。单细胞RNA测序使研究人员能够研究单个细胞之间的异质性,并从转录组的角度发现和定义新的细胞亚型。随着测序技术不断发展,单细胞测序技术具有高深度与高通量的优势,同时还可以...
【关键词】 单细胞RNA测序数据集 ; 聚类分析 ;
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【学位论文】 作者:吴昊楠 导师:李国君 山东大学 数学 运筹学与控制论(硕士) 2023年
【摘要】 蛋白质通常通过与另外的一个或者多个蛋白质进行物理接触形成蛋白质-蛋白质复合物来发挥生物学功能。蛋白质-蛋白质相互作用在细胞系统中发挥了关键的作用,诸如转录、翻译和代谢调控。因此,蛋白质相互作用位点的鉴定对于理解各种生物学过程以及疾病发病的分...
【关键词】 图神经网络 ; 蛋白质-蛋白质相互作用 ;
- 概要:
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- 结论:
【学位论文】 作者:姚鸿彬 导师:李国君 山东大学 数学 运筹学与控制论(硕士) 2023年
【摘要】 随着生物技术的快速发展,生物信息数据呈现指数级的增长,对生物大数据的研究已无法依靠原始的观察手段,同时计算机科学和信息技术的迅猛发展,使得我们对于大数据的储存、分析和挖掘更加便捷。因此,一门新兴的综合利用数学、生物学、计算机科学和信息技术的...
- 概要:
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- 结论:
【学位论文】 作者:祁俊海 导师:李国君 韩仁敏 山东大学 数学 金融数学与金融工程(硕士) 2022年
【摘要】 近年来,牛津纳米孔测序技术的应用极大的促进了生命科学的发展,测序的过程很容易被理解,一开始,DNA双链解开成单链,DNA单链通过“纳米孔”,DNA单分子停留在孔道,一些离子带来电流变化,不同的碱基(A,T,C,G)可以带来不同的电流变化。然...
- 概要:
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【学位论文】 作者:刘翔宇 导师:李国君 Michael Zhang 山东大学 数学 运筹学与控制论(博士) 2021年
【摘要】 随着高通量测序技术的发展,大规模基因表达数据的积累速度越来越快。如何借助数学方法从海量的表达数据中挖掘有效信息成为了一个极大的挑战。表达数据中一个至关重要的信息就是基因表达的相关关系。它可以帮助我们实现对未知基因的功能注释,理解基因间的调控...
- 概要:
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- 结论:
【学位论文】 作者:梅清琳 导师:李国君 苏正昌 山东大学 数学 运筹学与控制论(博士) 2021年
【摘要】 随着细胞分离技术和高通量测序技术的发展及应用,使对单个细胞中的序列信息进行测序成为可能,大量以单细胞为分辨率的组学数据随之出现,包括转录组、基因组和蛋白质组等。这些不同形式的单细胞组学数据迅速积累,基于传统批量组学数据的分析方法已难以满足对...
- 概要:
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- 结论:
【学位论文】 作者:于婷 导师:李国君 山东大学 数学 运筹学与控制论(博士) 2020年
【摘要】 随着生物技术的迅猛发展,生物信息数据资源呈现出爆炸式增长的趋势,同时计算机技术与互联网技术日益提高,使得对于大数据的储存、处理及传输更为便捷,对于生物大数据的整合与数据挖掘成为生命科学研究中的重要组成部分。基于计算机科学、数学与生物学的一门...
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