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【学位论文】 作者：闫鹏程 导师：林魁 北京师范大学 生物学 生物信息学（硕士） 2011年
【摘要】 结合新一代测序技术,进化实验可以方便的研究基因组变异与微生物进化之间以及与特定环境之间的关系。本研究在缺氮条件下和正常条件下分别对大肠杆菌种群进行了200天,约1300代的长期培养并利用高通量测序技术对进化实验中的11个进化种群和2个祖先种...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：李伟 导师：林魁 北京师范大学 生物学 生物信息学（硕士） 2011年
【摘要】 微生物群落拥有丰富的物种多样性,每个物种都有自己的一套基因、细胞组成和代谢反应,并不断与周围环境发生着复杂的相互作用。传统的研究方法已不能告诉我们群落中发生了什么代谢反应,同时高通量测序技术的快速发展促进了群落基因组学(宏基因组学)这一新兴...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：李臻 导师：林魁 北京师范大学 生物学 生物信息学（硕士） 2011年
【摘要】 被子植物是地球陆地生态系统的优势类群,它们的产生以及快速的分化依旧令人不解。早先的研究表明,相比于其它真核生物,全基因组复制在被子植物的进化过程中多次发生,并且可能帮助被子植物的祖先度过了白垩纪.第三季间期的物种大灭绝时期,并促进了随后的适...
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【学位论文】 作者：庞尔丽 导师：林魁 北京师范大学 生态学 生态学（博士） 2011年
【摘要】 在蛋白质-蛋白质相互作用水平上研究蛋白质对理解其功能与进化具有重要的意义。目前在蛋白质组水平上,利用高通量技术和生物信息学方法,进行蛋白质-蛋白质相互作用的研究主要有两个层次的工作：①大规模发现相互作用的蛋白质；②对于这些相互作用的蛋白质,...
- 概要：
- 方法：
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【学位论文】 作者：吴杨 导师：林魁 北京师范大学 生物学 生物信息学（硕士） 2010年
【摘要】 随着新一代测序技术的发展，越来越多的基因组正在或将要被测序，使得搭建良好的基因组注释平台变得日益重要。随着基因组学相关研究的深入，RNA基因、重复序列等元件的注释已成为真核基因组注释流程中的重要组成部分。重复序列中的转座元件在基因组进化中扮...
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- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：付聪 导师：林魁 Dr.Edwin Wang 北京师范大学 生物学 生态学 生物信息学（博士） 2010年
【摘要】 系统生物学是综合实验科学、数学以及计算机技术来解释复杂生物学和生理学现象的研究。生命科学应用领域高通量技术的进步，推动了系统生物学的产生和发展。在这里，通过使用系统生物学的方法，结合人类信号网络、癌症患者样本数据以及各类细胞内分子相互作用数...
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- 结论：
【学位论文】 作者：张珊珊 导师：林魁 北京师范大学 生物学 生物信息学（硕士） 2009年
【摘要】 KEGG数据库（http：//www．genome．jp/kegg/）是由日本Kyoto大学负责维护和管理的著名代谢通路数据库。在这篇论文里，我们对KEGG（release-42）数据库进行了本地化，建立了21个表并理清了各个表之间的相互关...
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- 结论：
【学位论文】 作者：赵磊 导师：林魁 北京师范大学 生物学 生物信息学（硕士） 2009年
【摘要】 全基因组数据库的可视化技术在生物信息学研究中扮演着重要的作用。优秀的可视化技术能够加快生物学研究的进展，而不良的可视化则会阻碍了研究人员的理解、思考、分享和交流。近年来，基因组浏览器和代谢通路数据库的可视化都取得了长足的进展，通用基因组浏览...
- 概要：
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