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【学位论文】 作者：温权 导师：欧竑宇 上海交通大学 生物学 生物工程（硕士） 2016年
【摘要】 本研究通过在高性能计算机群上重构和更新细菌基因组序列比对工具mGenomeSubtractor，对48株已全测序的肺炎克雷伯菌基因组进行了亲缘菌之间及和人类微生物基因组计划序列的比较分析，识别了肺炎克雷伯菌中菌株特有区域及其携带的耐药和致病...
- 概要：
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【学位论文】 作者：毕德玺 导师：欧竑宇 上海交通大学 生物学 生物学（博士） 2015年
【摘要】 微生物能够通过基因水平转移的方式获得致病和耐药等相关基因。质粒、插入序列（insertion sequence，IS）、转座子、整合子、整合性接合元件（integrative and conjugative element，ICE）和其它基...
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【学位论文】 作者：卫以青 导师：魏冬青 欧竑宇 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2015年
【摘要】 肺炎克雷伯菌（Klebsiella pneumonia）是医源性感染中最重要的革兰阴性条件致病菌之一。其携带的质粒和其他可移动遗传元件快速地介导了获得性耐药基因的播散，包括引起全球广泛关注的碳青霉烯类抗生素耐药基因。细菌耐药质粒常编码Rel...
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【学位论文】 作者：王静 导师：欧竑宇 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2015年
【摘要】 ε-聚赖氨酸(ε-PL)是最初在白色链霉菌 Streptomyces albulus NBRC14147的发酵液中所发现的，由 L-赖氨酸单体之间通过α-羧基与ε-氨基缩合形成的聚合度分布为25~35的一种天然氨基酸同聚物。目前通过化学染料...
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【学位论文】 作者：李骏 导师：张雪洪 欧竑宇 上海交通大学 生物学 生物学（博士） 2015年
【摘要】 肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)是院内感染最重要的多重耐药条件致病菌之一.11个不同来源的肺炎克雷伯菌基因组已被全测序,包括耐碳青霉烯类抗生素的、属于ST11型中国流行克隆株的临床菌株HS11286.近期发现的Ⅵ分...
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【学位论文】 作者：刘林梦 导师：欧竑宇 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2014年
【摘要】
本研究通过文献挖掘和生物信息学分析，对细菌基因组岛和其相关遗传元件进行了识别和比较分析。并以碳青霉烯酶KPC产生菌肺炎克雷伯菌临床菌株HS11286为例进行了具体分析。
细菌基因组差减杂交模拟工具mGenomeSubtractor...
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【学位论文】 作者：李静 导师：欧竑宇 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2013年
【摘要】 随着 DNA测序技术的进步,迄今为止已有近两千原核生物基因组被全测序,而二代测序技术的广泛应用更是推进了细菌转录组的研究。面对海量组学数据的剧增,急需大规模深度挖掘这些重要微生物资源。本论文以细菌硫肽生物合成基因簇预测和细菌非编码 RNA序...
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【学位论文】 作者：刘平磊 导师：欧竑宇 上海交通大学 生物学 生物工程（硕士） 2012年
【摘要】 革兰氏阴性肠杆菌科肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)是医源性感染最重要的条件致病菌之一。随着抗菌素的泛用，多重耐药性正在它们中广泛传播，给临床抗感染治疗带来极大的困扰。研究发现许多与致病和耐药等相关的基因，可借助接合...
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