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【学位论文】 作者：李宴美 导师：Christian Reidys 南开大学 数学 应用数学（博士） 2011年
【摘要】 本文的研究对象是现行所知的作为生命关键组成部分之一的一类生物分子一核糖(RNA)分子。之前的研究发现，RNA二级结构以及RNA伪扭结结构在我们自然界生命职能中起着极其重要的作用，并且一部分RNA在分子中具有反应活性。更重要的是对伪扭结结构的...
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- 方法：
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【学位论文】 作者：黄文达 导师：Christian M.Reidys 南开大学 数学 应用数学（博士） 2011年
【摘要】 在本文中，我们首先在第2章介绍了一个以均匀概率生成k不相交，模块图的算法。这个算法能在经过0（nk）的时间和空间复杂度的预处理后，以O(n)的时间和空间复杂度产生k不相交，σ模块图。其次我们把注意力集中在单链的核糖核酸序列的折叠问题上。在第...
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【学位论文】 作者：靳宇 导师：Christian M.Reidys 南开大学 数学 数学;应用数学（博士） 2010年
【摘要】 本文主要是对RNA序列结构进行组合分析,从而进一步优化现有预测RNA结构的算法。我们提出了对RNA带扭结结构的新的分类方法,更有效的推广归纳了二级结构,即我们将结构表示成简图,根据最多彼此相交的碱基对k-1来划分带扭结的结构。k=2时就是R...
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【学位论文】 作者：秦晶 导师：Christian Reidys 南开大学 数学 数学;应用数学（博士） 2010年
【摘要】 本文主要涉及核糖核酸(RNA)本身三级结构和核糖核酸之间相互作用结构的一些组合学和计算生物学的相关结果。假设k为正整数,k不相交tangle图这一组合概念起源于计算生物学对核糖核酸三级结构的研究。众所周知,在[14]中,陈永川教授等建立了集...
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【学位论文】 作者：马刚 导师：Christian M.Reidys 南开大学 数学 数学;应用数学（博士） 2010年
【摘要】 RNA在蛋白质合成中发挥着非常重要的作用。RNA包含转移RNA(tRNA),信使RNA(mRNA)和核糖体RNA(rRNA)。转移RNA起着携带和转移活化氨基酸的作用；信使RNA是合成蛋白质的模板：核糖体RNA是细胞合成蛋白质的主要场所。R...
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【学位论文】 作者：张晏玮 导师：Christian Reidys 南开大学 数学 应用数学（硕士） 2010年
【摘要】 数学作为一种手段已经越来越广泛的应用在各门学科中，这篇文章就是以组合数学为主综合几种数学方法解决了计算生物学中关于RNA分子的一些实际问题。我们采用目前通用的二维示意图的方法来表示RNA结构并对其进行分类，这篇文章的研究对象是最小边长为4的...
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【学位论文】 作者：高志明 导师：Christian M.Reidys 南开大学 数学 应用数学（硕士） 2009年
【摘要】 本文研究对象是生命系统中具有关键作用的一类生物大分子—核糖核酸(RNA)分子，RNA的分子结构呈现出多样的变化性。其中最基本的一级结构是四种碱基(A，C，G和U)在其分子基链上的排列顺序，称为RNA序列。二级结构是RNA序列上不同的碱基在W...
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【学位论文】 作者：李顺 导师：Christian Reidys 南开大学 数学 应用数学（硕士） 2008年
【摘要】 为了研究生物进化,Eigen (1971)引入了一个关于分子进化的动态理论-准生物种群模型。在这一模型中,有两个概念非常重要。一个是适应值结构,另一个是错误阈。总的来说,适应值结构是指一个映射f:C→R,它给每-个C中的构型赋一个实数值。这...
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【学位论文】 作者：刘呈波 导师：Christian Reidys 南开大学 数学 应用数学（硕士） 2008年
【摘要】 RNA分子是计算生物学中研究的一种重要聚合物。RNA分子的一个重要功能是把遗传信息从DNA传送到蛋白质，而RNA的功能和性质与RNA的结构有密切的关系。由于在试验室直接观察RNA结构非常困难，数学家和理论生物学家通过分析RNA序列来预测RN...
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