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【中文期刊】 程翠林 王路 等 《生物信息学China Journal of Bioinformatics》 2017年15卷2期 134-136页 ISTIC
【摘要】 生物分离工程是高等学校生物工程专业的基础课程,与生产实践密切相关.教学过程中采用参与式教学方法能够培养学生工程设计的创造性思维,并且提高学生的工程化能力.本研究从科研融入教学、开展课堂讨论、运用多媒体手段、开设工厂课堂等4个方面介绍课堂教学...
【中文期刊】 魏冬凯 南蓬 等 《生物信息学China Journal of Bioinformatics》 2017年15卷1期 33-45页 ISTIC
【摘要】 RRBS(简化甲基化测序)是一种有效研究DNA甲基化状态的测序方案.文库构建是该方案中最关键的实验步骤之一,RRBS文库构建往往因为酶切产物少,文库构建步骤繁多等因素,导致DNA起始量需要1 ug以上.然而很多来源于人的样本,如冰冻组织穿刺...
【中文期刊】 赵媛媛 王耘 《生物信息学China Journal of Bioinformatics》 2017年15卷1期 46-54页 ISTIC
【摘要】 组合药物在复杂疾病的治疗中形成了多靶点,多环节上的密切联系,对疾病的治疗效果也可达到单种药物治疗意想不到的效果.组合药物中各单药功能各异但联用后治疗效果更佳,说明所对应疾病之间可能存在某种关系.通过研究疾病间关联关系,可能会发现治疗某种疾病...
【中文期刊】 王敬敬 赵维 等 《生物信息学China Journal of Bioinformatics》 2017年15卷2期 127-133页 ISTIC
【摘要】 探针设计是制备高质量基因芯片的重中之重.ARB软件是用于设计系统发育芯片(PhyloChip)探针的主要软件,然而由于安装困难、相关中文文章较少等原因,阻碍了其在国内的广泛使用.本文详细介绍了ARB软件的安装方法、探针设计及其他功能.这将有...
【中文期刊】 齐燕姣 陆会宁 等 《生物信息学China Journal of Bioinformatics》 2017年15卷1期 59-68页 ISTIC
【摘要】 莪术醇是近年来发现的重要的新的抗肿瘤中药单体之一.分析莪术醇与转运蛋白-血清白蛋白之间的相互作用能够帮助研究者更好的理解药物的作用机制.本文通过用多序列分析、进化关系和分子对接技术等分析莪术醇与人血清白蛋白相互作用位点及其在其他亲缘关系较近...
【中文期刊】 吴丹丹 阮伋 等 《生物信息学China Journal of Bioinformatics》 2017年15卷3期 196-200页 ISTIC
【摘要】 尽管二代基因组测序技术日渐流行,Sanger测序依旧是SNP识别和分析的金标准.传统对于Sanger测序结果的分析多依赖SeqMan等软件进行.然而这类软件大多依靠人工操作来识别和记录测序结果中的SNP位点,效率低下且容易发生错误.此外,当...
【中文期刊】 刘立伟 刘铁晖 《生物信息学China Journal of Bioinformatics》 2017年15卷1期 55-58页 ISTIC
【摘要】 本研究提出了一种新的RNA二级结构的图形表示方法,这种方法不同于以往的表示方式.根据所提出的RNA二级结构的图形表示,将对9种病毒的RNA二级结构进行图形表示,构建系统进化树,进行序列间相似性的比较和分析.根据最终结果,可以很清晰地发现,A...
【中文期刊】 陈凤珍 李玲 等 《生物信息学》 2016年14卷1期 56-60页 ISTIC
【摘要】 随着高通量测序技术的快速发展,下一代测序技术也迅速发展为生物领域中的主流技术,而理解下一代测序数据最重要的一步是比对。比对是进行后续生物信息分析的基石,也因此催生了很多比对软件。本文主要选取了四种常用的比对软件Bowtie2、BWA、MAQ...
【中文期刊】 曹晨 马堃 《生物信息学China Journal of Bioinformatics》 2016年14卷3期 181-187页 ISTIC
【摘要】 蛋白质二级结构是指蛋白质骨架结构中有规律重复的构象。由蛋白质原子坐标正确地指定蛋白质二级结构是分析蛋白质结构与功能的基础,二级结构的指定对于蛋白质分类、蛋白质功能模体的发现以及理解蛋白质折叠机制有着重要的作用。并且蛋白质二级结构信息广泛应用...
【关键词】 蛋白质二级结构指定; 蛋白质结构; Protein secondary structure assignment;
【中文期刊】 吴金华 张艳秋 等 《生物信息学》 2016年14卷4期 249-253页 ISTIC
【摘要】 基因组和蛋白质结构与功能方面已积累了海量数据。如何从海量数据中获取有效信息成为生物信息学迫切要解决的问题。本文以相关主题词检索文献,分析了该领域历年文章数量、发文最多的机构和作者、被引用频次居前论文、期刊载文量,并对关键词和被引用频次居前论...